在不动的状态下吸收自然力量，控制仙术查克拉。此时深作告诫鸣人有关仙人模式的缺点，就是只能维持5分钟左右；而且每一次使用前，需经一段时间、在静止的状态下吸取足够的自然力量方可。因此如果在不动的状态下，就很容易成为敌人的靶子。为免如此，使用时就必须有其他伙伴同在，以为其争取充裕的时间吸收自然力量。但深作自认为最有效的方法，就是与鸣人融为一体，以求能同时分担「动」和「静」两边的工作。另一边厢，木叶隐村正受到佩恩的摧毁，身为五代火影的纲手，只能祈求鸣人这位「预言之子」的回归。天道佩恩由于得知鸣人在妙木山修行，使出究极版神罗天征摧毁了整个木叶村，好在纲手及其蛞蝓保护了大家。后鸣人等被志麻仙人通灵回满目疮痍的木叶村，六道佩恩齐聚准备捕捉九尾，鸣人从纲手那得知卡卡西死后，让其他人不要帮忙单挑六道。鸣人实力大增仙人模式加上新术仙法·风遁·螺旋手里剑，且在两位仙人的帮助下本是压倒性优势。但由于佩恩秘密过多且实力强大，终费劲艰辛打败5个佩恩，只剩下天道尚存。此时深作仙人被天道杀死，仙人模式也解除，无法逆转之下被天道擒获。一番谈话下，鸣人不置可否。后雏田为救鸣人而出被天道打败，鸣人误以雏田死亡，愤怒之下爆发九尾之力，现出八条尾巴，后被天道用地爆天星困住。在被九尾怂恿之下准备揭开封印之时四代出现，才得知自己的身世，四代与鸣人交谈后再次重新封印九尾并提醒鸣人这是最后一次。由于九尾被封印鸣人脱离地爆天星的束缚以仙人模式再战天道，一番努力后终于打败天道并用逆向探查找到佩恩本体-长门。两位预言之子相遇。之后与鸣人的交谈中，长门被鸣人的嘴遁感化。放弃和带土原定计划，决定将接力棒交到鸣人手中。期盼鸣人能够完成几代人的使命....................完成《鸣人物语》！！长门也因施展外道·轮回天生之术耗尽生命力而死（救回木叶村在此战中死亡的人）。鸣人送走小南回到木叶成为木叶村的英雄。
忍界大战篇
鸣人与奇拉比一同奔赴战场。路途中遇到长门和鼬。鼬摆脱兜的控制后帮助鸣人
与比封印长门，并将佐助托付于鸣人。另外赶往另一战场的一个鸣人分身帮助我爱罗他们打败二代土影分身，接着与三代雷影对决时找到其弱点并用仙人模式打败了他。兜控制的二代土影通灵出宇智波斑，其后五影到齐与斑作战。鸣人查克拉到达极限，受五影的托付后解除分身。本体和奇拉比在前进的路上遭遇带土率领的人柱力们。但寡不敌众而处于劣势，卡卡西和凯赶到帮助鸣人他们共同作战。后鸣人说服四尾，并接受了四尾的托付，九尾在这时决定与鸣人对拳并一起并肩作战。第一次真正的尾兽化，但只能坚持五分钟。在短短的时间内拔出二尾、三尾、五尾、六尾和七尾5个人柱力身上的所有黑棒。是继六道仙人以后第二个被二到九尾（一尾忍界大战无人柱力未登场）认同的人，并在九喇嘛、奇拉比、八尾牛鬼、卡卡西和凯的帮助下共同对抗带土，带土在只获得八尾一只触角和金银兄弟的九尾查克拉的情况下准备强行复活十尾。为了阻止十尾复活，鸣人等人联手攻击面具男，最终卡卡西破解了面具男时空忍术并且成功打伤带土最终击碎了带土的面具。后来解除秽土转生契约的宇智波斑来到了战场，与带土一起作战在斑和带土合作下成功复活了十尾，在这时忍者联军登场用五大国组合忍术封住了十尾但可惜十尾的力量是惊人的摆脱了束缚并对忍者联军指挥部开了一
发尾兽炮直接命中。十尾发动木遁.插钎之术袭击忍者联合军，宁次为保护鸣人和雏田不幸牺牲，死在鸣人怀里。鸣人在带土的讥讽质问中几近动摇，但在雏田的安慰和九尾的训斥中恢复了精神。鸣人把九尾再次制造出的查克拉调整成适合每个忍者各自不同的类型，把九尾查克拉输送到联军每个成员身上。
再会历代火影
千手柱间，千手扉间，猿飞日斩，波风水门四位火影因秽土转生复活，宇智波佐助也决定了回到木叶，几人与鹰小队，大蛇丸一起前往第四次忍界大战战场，营救负伤的五影。在漫画631话中，千手柱间，千手扉间，猿飞日斩，波风水门，宇智波佐助到达战场，原第七班再会，鸣人与佐助终于并肩作战！在641话中，最终boss只剩下十尾人柱力带土和秽土转生的宇智波斑，鸣佐二人和二代，四代火影一起对抗十尾人柱力带土，初代对抗宇智波斑。但十尾人柱力带土一人用阴阳遁（可将世间一切忍术无效化）对抗四个影级别忍者，在二代火影和鸣人都察觉到仙术对带土攻击有效此时，鸣人同时开启仙人模式和尾兽模式，开始反攻。在645话，带土在战场上重新释放出十尾。十尾变成参天巨树，树木顶端结有一颗硕大的花果，内有双圈六勾玉之眼，当眼中的瞳术映到月亮上时，无限月读便即完成。648话中由鸣人（仙人模式+尾兽模式）、佐助（须佐能乎+咒印）和初代目火影（仙人模式）带领众人对带土攻击，阻止无限月读。