丘俭、扬州刺史文钦果然起兵反叛。司马师对王肃说：“当年霍光被夏侯胜的言论感动，开始重视儒学之士，确实有道理。如今安定国家、辅佐君主，该用什么办法？”
王肃答道：“从前关羽率荆州之众，在汉水边招降于禁，于是有了北上争夺天下的野心。后来孙权袭击关羽将士的家属，关羽的军队立刻土崩瓦解。如今淮南将士的父母妻儿都在内地各州，只要迅速出兵抵御，阻止叛军前进，他们必然会像关羽军队一样崩溃。” 司马师采纳了他的建议，最终平定了毋丘俭、文钦的叛乱。
后来王肃升任中领军（禁军统帅），加授散骑常侍，食邑增加三百户，累计达二千二百户。甘露元年去世时，穿着丧服前来吊唁的门生有数百人。朝廷追赠他为卫将军，谥号 “景侯”，其子王恽继承爵位。王恽去世后无子，封国废除。景元四年，朝廷封王肃之子王恂为兰陵侯。咸熙年间推行五等爵制，因王肃在前朝功勋卓着，改封王恂为氶子（子爵）。
（《世语》记载：王恂，字良夫，有通达的见识，在朝忠正不阿，历任河南尹、侍中，所任官职都有良好声誉。他一心为公，有不顾自身的气节。鬲县县令袁毅赠送骏马，王恂知道袁毅贪财，拒绝接受。袁毅最终因贪污败露。王恂还主持建立太学、地方学校，尊崇儒家五经，都是他的功绩。王恂四十多岁去世，追赠车骑将军。王肃的女儿嫁给司马昭（司马文王），即晋文明皇后，生下晋武帝司马炎和齐献王司马攸。《晋诸公赞》记载：王恂有兄弟八人，其中显达者如王虔，字恭祖，以办事干练着称，官至尚书；弟弟王恺，字君夫，年轻时有才华但行为不端，与卫尉石崇交好，两人以豪奢攀比闻名，官至后将军。王虔之子王康、王隆，仕途也通达，为后世所推重。）
王肃年轻时精通贾逵、马融的经学（东汉古文经学代表），但不认同郑玄（东汉经学集大成者）的学说。他广泛采集各家异同，为《尚书》《诗经》《论语》《三礼》《左传》作注，并整理父亲王朗的《易传》，这些着作均被朝廷列为官学教材。他针对朝廷典制、郊祀礼仪、宗庙制度、丧纪规格等议题撰写的驳论文章，多达百余篇。
当时乐安人孙叔然（因与晋武帝司马炎同名，故称字）是郑玄门下弟子，被称为 “东州大儒”。朝