当时，太尉黄琬、司徒杨彪、司空荀爽一同去见董卓。董卓又提出迁都的事，还说：“昔日高祖定都关中，历经十一代后汉室中兴，便迁都洛阳。从光武帝到现在，又历经十一代，按照《石苞室谶》的说法，应该再次迁都回长安。”众人听了，都惊愕得不敢出声。杨彪再次站出来反对：“迁都改制是天下大事，应当顺应民心，根据时势来决定。当年盘庚五次迁都，百姓都满心怨言，盘庚作了三篇文章才让大家明白。以前王莽篡逆，更改五常，更始帝和赤眉军时期，长安被焚烧，百姓惨遭杀害，流离失所，如今百不存一。光武帝顺应天命，迁都洛邑，这才是正确的选择。现在刚刚拥立圣主，想要光大汉室，却无缘无故舍弃宫庙、抛弃园陵，恐怕百姓会惊恐不安，无法理解，必定会引发骚乱。《石苞室谶》不过是妖邪之书，怎能轻信？”董卓恼羞成怒，喝道：“杨公是想阻挠国家大计吗？关东方乱，贼寇四起。崤山和函谷关地势险要，是国家的重要防线。而且从陇右获取木材，建造宫室也不难。杜陵南山下有汉武帝时期的陶窑旧址，制作砖瓦很快就能完成。建造宫室官府根本不是问题！百姓无知，不必与他们商议。要是有人敢反对，我就用大军驱赶，看他们还敢不敢不听话！”百官们听了，都吓得脸色惨白。黄琬赶紧劝道：“这可是大事，杨公的话，您不妨再仔细想想！”董卓却根本不听，当天就命令司隶校尉弹劾杨彪和黄琬，将他们二人免官。
随后，董卓便胁迫天子迁都长安。他还下令让自己的部队烧毁洛阳城方圆百里的地方，自己更是亲自带兵烧毁了南北宫、宗庙、府库以及百姓的房屋，洛阳城内被洗劫一空。他又将城中的富户们抓起来，随便给他们安个罪名，就没收他们的财物，许多无辜之人因此丧命，不计其数。
董卓对待俘虏的手段更是残忍至极。他抓到山东的士兵后，会用十几匹涂满猪油的布缠在他们身上，然后点火焚烧，从脚开始烧起。袁绍的豫州从事李延被他抓住后，更是被他下令煮杀。董卓有个宠爱的胡人，平日里仗着董卓的宠爱肆意妄为，被司隶校尉赵谦杀了。董卓得知后，暴跳如雷，怒吼道：“我心爱的狗，我都不许别人呵斥，更何况是人！”于是，他下令将司隶都官抓来，当场打死。
迁都长安后，董卓自封为太师，还想让别