三年转瞬即逝，地球表面的重建工作如火如荼。东京湾凝结的暗金色晶体被炼制成防护材料，昆仑山脉断裂的灵脉用上古秘术重新接驳，天机阁遗址上矗立起一座融合古今科技的新总部——「天穹中枢」。林羽每日在中枢顶层闭关，试图参透归墟钥中残留的圣人意志，然而暗星危机带来的阴影始终挥之不去。
这天，阿依娜突然冲进闭关室，银链末端的星图碎片剧烈震颤：「监测到太平洋马里亚纳海沟出现异常能量波动，频率和三年前暗星投影降临前的征兆如出一辙！」全息投影中，海沟深处闪烁着诡异的靛蓝色光芒，声波扫描显示，那里竟存在着一座与地球板块运动无关的巨型建筑。
沈梦璃将新锻造的镇魔剑背负身后，剑身上镶嵌着从暗星残骸中提取的「星陨铁」：「海沟深处的水压足以碾碎任何金属，普通潜艇根本无法靠近。」她话音未落，玄机子的全息影像突然显现，这位重伤后一直闭关的智者面容愈发枯槁：「启动‘应龙号’吧，那是用太古龙族遗骨与现代科技结合打造的深海战甲。」
当「应龙号」破开海面时，整个天穹中枢都为之震颤。这艘形似上古蛟龙的战甲，鳞片由暗金色晶体与星陨铁交织而成，龙目位置是能穿透千米深海的「太虚探照仪」。林羽等人刚踏入驾驶舱，归墟钥突然悬浮而起，表面符文化作流光注入控制台——战甲竟与圣物产生共鸣，龙尾处的推进器喷射出五色光芒，瞬间没入深海。
随着深度增加，海水温度骤降至冰点，四周的黑暗中不时掠过通体透明、散发荧光的变异生物。当「应龙号」抵达海沟底部时，一座布满混沌纹路的巨型金字塔出现在视野中。金字塔顶端漂浮着一颗不断膨胀收缩的靛蓝色球体，每一次脉动都在撕裂周围的空间，形成细小的时空裂缝。
「这不是自然形成的建筑。」阿依娜放大扫描画面，惊觉金字塔基座上刻满了与暗星能量波动同源的符号，「这些文字记载着‘溟渊之主’的传说，据说它是混沌初开时诞生的深渊意识，被太古圣人封印在宇宙边缘。」她的声音突然颤抖，「星图碎片显示，暗星降临只是诱饵，真正的目标是唤醒溟渊之主！」
话音未落，金字塔突然迸发出靛蓝色光芒，无数形似章鱼的「溟渊使徒」从裂缝中游出。这些怪物的触