北京当时却不是全国水运枢纽，中原、江南等地的税赋、盐粮、贡品要运往京城，全部都要通过京杭大运河，俗称“漕运”。但是，随着黄河水患不断，人们把河堤筑得越来越高，黄河的水位也就越来越高，水患一来，黄河水就倒流到淮河中，明朝开朝以来，黄河水“夺淮”竟有百次之多。黄河的黄沙不断地侵入于淮河相连的京杭大运河中，造成京杭大运河河床抬高，不断淤塞，全国物资不能按时运往京城，给朝廷带来了经济命脉的威胁。
万历知道，这“蓄清刷黄”如果成功，淮河水患就会随之消除，以后京杭大运河水位升高，大船也就可以通行，在灾年或者战事发生的时候，南北物资的顺畅流通意味着什么，万历非常清楚。
不一会儿，太监传讯，潘季驯已经到了，万历传了他进来。
“微臣参见皇上。”
万历看着跪在眼前的潘季驯，看他已经年近六十，两鬓苍白，黑膛的脸色，上面皱纹沟壑纵深，分明是长期在户外风吹日晒之故。万历心存怜惜，忙起身绕过书桌，亲手扶潘季驯起来，说道：“潘卿家免礼。”
潘季驯抬头看了一眼皇上，看到皇帝年轻的脸庞，关切的眼神，他心头一暖，但臣子毕竟不能盯着皇上看，他马上又低下头，说道：“谢皇上。皇上，不知可看过微臣的奏章？”
“朕已经仔细看过了，潘爱卿治水有道，这次的两河治理方案，朕十分赞同，只是不知具体要起多少工程，费多少银两，时间又要花多久呢？”